Il Credito Varesino venne costituito il 27 marzo 1898, con la denominazione di Banca Cooperativa di Varese e Circondario, per iniziativa di un gruppo di imprenditori locali. Al capitale iniziale concorsero 248 soci, che sottoscrissero complessivamente n. 2.030 azioni da lire 50 ciascuna. L'Istituto iniziò ad operare nel mese di giugno con uno sportello nel centro di Varese. Nel 1906, a seguito della fusione con il Banco Mazzola Conelli, assunse la definitiva denominazione e alla presidenza fu nominato il titolare del Banco, cav. Cesare Mazzola Conelli. L'Istituto crebbe in parallelo con lo sviluppo produttivo della zona, indirizzando la propria attività verso le medie aziende e l'artigianato, fino ad assumere una posizione preminente nel settore creditizio della provincia di Varese. Si ebbe perciò un primo aumento di capitale a lire 1.500.000 nel 1912. Nello stesso anno inoltre furono acquisite la Banca Pellini & C. di Luino e la Banca Popolare di Besozzo, entrambe trasformate in proprie filiali. La solidità patrimoniale consentì alla Banca di superare le difficoltà che seguirono alla liquidazione fallimentare nel 1913 del più antico istituto cittadino, la Banca di Varese. In questo periodo la Banca assunse la gestione della civica esattoria rimasta scoperta e provvide anche al collocamento di un prestito obbligazionario emesso dallo stesso Comune. Durante la guerra proseguì nella sua attività di sostegno all'economia provinciale e di collaborazione con il Governo nella raccolta del risparmio e nel collocamento dei prestiti nazionali successivamente emessi. Per far fronte alle esigenze di ricostruzione, nel dopoguerra elevò il proprio capitale a lire 2 milioni nel 1919 e poi a lire 5 milioni nel 1921. Dal 1920 al 1925 il movimento generale delle operazioni più che raddoppiò, da lire 6 a 14 miliardi. Seguì un ulteriore aumento del capitale a 10 milioni nel 1927, anno nel quale fu costituita la provincia di Varese. L'espansione sul territorio, ripresa nel 1922 con l'apertura di una filiale a Tradate, accelerò negli anni Trenta. L'Istituto assunse la filiale di Saronno dell'Unione Bancaria Nazionale in liquidazione nel 1932 e si insediò a Busto Arsizio, con l'acquisizione del Banca di Busto Arsizio nel 1935; all'inizio del 1939 aprì quattro agenzie nel varesotto; nel 1941, trasformò il recapito di Milano, operativo sin dal 1935, in una filiale. Nel contempo, iniziò a guardare anche all'estero, partecipando dal 1920, insieme ad altri istituti, alla Banca Italiana per la Cina, l'unica banca italiana che operò nel paese orientale con continuità nella prima metà del 20° secolo. Incrementato il capitale a lire 25 milioni nel 1939, il Credito Varesino ottenne l'autorizzazione alle operazioni di credito agrario di esercizio e poi all'emissione degli assegni circolari. La Banca fu guidata negli anni del conflitto mondiale dall'avv. Giuseppe Bianchini, già direttore e presidente dell'Associazione Bancaria Italiana tra gli anni '20 e la prima metà degli anni '30. Aumentato il capitale a lire 100 milioni all'inizio del 1946, l'Istituto - con l'apertura di 6 nuovi insediamenti - riprese la sua espansione nel varesotto, poi proseguita negli anni '50 e '60 spinta della crescita economica della zona in cui operava: all'inizio degli anni '70 giunse ad avere 39 sportelli. Nel 1972, avendo superato i 400 miliardi di fondi amministrati, assunse la qualifica di banca regionale; due anni più tardi venne quotata in Borsa. All'inizio del 1973, il 27% del Credito Varesino venne acquisito da La Centrale, che nei successivi esercizi aumentò gradualmente la sua partecipazione fino a raggiungere nel 1977, con oltre il 57% del capitale, il controllo della Banca, sostituendosi alla Invest del gruppo Bonomi. Con l'entrata di Roberto Calvi nel Consiglio di Amministrazione nel 1975, l'influenza del Banco Ambrosiano sulla gestione dell'Istituto divenne dominante. Il tracollo della banca milanese comportò una gravosa perdita per il Credito Varesino, che fu coperta nel 1984 senza ricorrere a riserve di patrimonio. Nel maggio dello stesso anno la Banca Popolare di Bergamo acquisì la quota di maggioranza (52,78%) dell'Istituto, incrementandola (61,83%) nel 1991. Il 23 luglio 1992 fu firmato l'atto di fusione per incorporazione del Credito Varesino nella Banca Popolare di Bergamo, che diede origine alla Banca Popolare di Bergamo-Credito Varesino.